Labuan Bajo, pintu ger menuju Taman Nasional Komodo, menawarkan sederet resort dengan fasilitas pantai pribadi dan akses langsung ke spot snorkeling kelas dunia. Sebagian besar resort berada di kawasan Waecicu Beach atau pulau-pulau kecil seperti Seraya, menyediakan akomodasi mulai dari kelas menengah hingga mewah. Fasilitas umum meliputi kolam renang outdoor, spa, restoran, dan layanan antar-jemput bandara. Bagi yang mencari petualangan bawah laut, banyak resort menyewakan perlengkapan diving dan snorkeling langsung dari dermaga pribadi.
Resort dengan rating tertinggi seperti Plataran Komodo Resort & Spa (skor 92) menonjol dengan program budaya dan pengalaman Phinisi eksklusif, cocok untuk pasangan romantis. Sudamala Resort, Seraya, Flores (skor 93) menawarkan pulau pribadi dengan house reef yang kaya biota laut. Untuk keluarga, AYANA Komodo Waecicu Beach (skor 92) memiliki kids club dan taman bermain. Sementara TA'AKTANA, A Luxury Collection Resort & Spa (skor 96) menyajikan kemewahan dengan tiga kolam renang dan spa lengkap. Meruorah Komodo Labuan Bajo (skor 86) cocok untuk pelancong bisnis dengan fasilitas fitness center dan ATM di lokasi.