Bunaken dikenal sebagai destinasi utama menyelam di Indonesia berkat Taman Laut Bunaken yang kaya terumbu karang. Resor-resor di sini umumnya berada di tepi pantai pribadi, menawarkan akses langsung ke spot menyelam dan snorkeling. Sebagian besar menerapkan konsep full board (termasuk tiga kali makan) dengan tarif mulai dari sekitar Rp2 juta per malam tergantung kelas dan musim. Pulau Siladen dan Pulau Bunaken menjadi dua area utama tempat resor beroperasi, dengan akses dari Manado menggunakan perahu sekitar 45-60 menit.
Siladen Resort & Spa menonjol sebagai resor ramah lingkungan dengan rating 97 dari tamu, dilengkapi kolam renang outdoor, spa tradisional, dan pusat menyelam. Bunaken Oasis Dive Resort and Spa meraih penghargaan berganda berkat fasilitas spa, bar bertingkat, dan balkon pribadi dengan pemandangan laut. Sementara itu, Kuda Laut Boutique Dive Resort di Siladen Island menawarkan vila butik dengan kolam renang dan teras atap yang memandang ke arah daratan Sulawesi. Semua resor tersebut menyediakan layanan antar-jemput bandara dan paket aktivitas air, namun biaya tiket masuk Taman Nasional Bunaken biasanya belum termasuk dalam tarif kamar.