Magelang menawarkan banyak pilihan guest house murah dengan tarif di bawah Rp100.000 per malam. Sebagian besar berlokasi di kawasan Borobudur, dekat dengan Candi Borobudur. Meski murah, guest house ini menyediakan fasilitas dasar seperti WiFi gratis, parkir gratis, kamar mandi pribadi, dan beberapa menawarkan sarapan. Cocok untuk backpacker atau wisatawan yang ingin menghemat biaya akomodasi tanpa mengorbankan kebersihan dan keamanan.
Beberapa guest house dengan rating tinggi antara lain Balkondes Kembanglimus (skor 90) yang menyajikan sarapan halal dan pemandangan taman, Omahku Homestay (skor 92) dengan AC, kamar mandi walk-in, dan layanan sewa sepeda, serta Omah Rohadi Syariah (skor 87) yang menerapkan konsep syariah. Ada juga RedDoorz Syariah near Akmil Magelang (skor 76) dengan harga terjangkau di dekat Akademi Militer. Disarankan memesan lebih awal saat musim liburan karena ketersediaan terbatas.